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时间:2022年11月25日 来源:

酵母双杂交还可以这么用?Y2H-seq 揭示不老松年龄。***小欧又给大家带来了一篇酵母双杂交结合高通量测序技术的应用文章。北京林业大学钮世辉老师团队,在传统的酵母双杂交技术流程基础上,巧妙的结合了NGS技术,优化建立了Y2H-seq技术,**缩短了常规的筛库后测序验证周期,节约了实验成本。文章中应用Y2H-seq技术,对不老松年龄密码进行了有趣的研究,其中所用酵母双杂交文库由欧易生物协助完成。众所周知,酵母双杂交技术是研究蛋白相互作用的利器。目前已知的蛋白质相互作用至少有一半是通过酵母双杂交技术发现的。但是做过酵母杂交实验的小伙伴也都知道蛋白筛选较容易,但是筛选后,想知道获得的阳性克隆都对应的是啥基因,所花费的人力物力相当不小。有困难解决困难,勇敢牛牛不怕困难。酵母文库质量检测酵母基因功能鉴定。天津建库酵母文库做什么

蛋白被泛素化后(即蛋白上结合了泛素),意味着将要被运往蛋白酶体降解,一般用于降解细胞内老弱病残蛋白,再回收利用。同时也被用于排除异己,抵御外敌。该过程需要一系列酶介导:泛素***酶(E1)、泛素偶联酶(E2)和泛素E3连接酶(E3)。其中E3是起特异性识别作用的,即决定谁该被降解,不能把好同志降解掉。所以E3基因很多,植物中主要有四种类型:HECT、RING、U-box和CRLs。其中CRLs是植物中含量**丰富的E3连接酶。本研究中,通过酵母双杂交筛选到的标题蛋白MdBT2,整好是CRLs亚家族之一。因此作者推测MdBT2可能在与ApNMV1a结合后,起到了促进其泛素化和降解的作用。天津建库酵母文库做什么欧易生物是国内较早提供酵母杂交技术服务的生物公司,较早掌握Gateway和Smart两种建库方法。

本研究通过酵母双杂交筛选,鉴定到 CRY1 可以与 SWR1 复合物关键亚基 SWC6、ARP6 结合,共同以蓝光依赖模式调控 H2A.Z 在染色质的沉积。蓝光***的 CRY1 可以增强 SWC6 与 ARP6 的相互作用。此外,HY5 也可以与 SWC6、ARP6 结合,将 SWR1 复合物募集到 HY5 靶向位置,调控 HY5 靶基因的表达,进而影响拟南芥下胚轴的伸长据此,本研究提出拟南芥光形态建成调控的分子机制:CRY1 通过增强 SWR1 复合物活性和 HY5 介导 SWR1 复合物向 HY5 靶基因的募集,共同促进 H2A.Z 染色质沉积,以调控 HY5 靶基因的表达和蓝光条件下光形态建成。

酵母双杂交技术,自创建以来被广泛应用于蛋白互作研究领域,在生命科学的基础探秘研究中起着重要作用。然而该技术设计初衷,*是斯坦利先生为了完成申请学校经费的目的。该技术设计巧妙,它的许多优点在设计之初并未显现,反而在这么多年的高频使用和进一步开发利用过程中越发明显。(引用自MarcVidal&StanleyFields的“Theyeasttwo-hybridassay:stillfindingconnectionsafter25years”):(1)尽管酵母杂交技术揭示了蛋白质结合位点的详细信息,但操作简单。只需2个质粒+1个菌株即可完成,且有不同体系方便选择。(2)该技术利用比较好的DNA结合位点,有效的***结构域和友好的报告基因系统,可以放大弱互作的信号。(3)该技术可用于各种物种的蛋白互作检测,具有物种普适性,尤其是人类蛋白。(4)衍生技术具有更***的应用,可扩展到检测蛋白质与DNA、蛋白质与RNA、蛋白质与小分子以及其他组合之间的相互作用,甚至可实现将生理相互作用与表型数据直接关联。当然,做过酵母杂交实验的小伙伴应该都了解,互作结果的判断,往往要等酵母生长好几天才能看出来(当然,小欧认为这在伟大的科研事业过程中算不上啥),互作强弱也是主观判断性较强,存在假阳性。酵母双杂交优惠快速出报告品牌欧易生物特色科学严谨准确。

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通过酵母双杂交文库进行了互作蛋白的筛选,结果显示TaTIFY9可以与TaSRL1相互作用(下图A),并通过Bi-FC、荧光互补实验得以证实(图B-C)。TaTIFY9属于茉莉酸信号途径关键因子JAZ家族的成员之一。RT-PCR显示TaTIFY9也主要表达于小麦根部,外源施加茉莉酸可以***诱导TaTIFY9表达。这一结果表明,TaSRL1可能通过与TIFY9结合介导了茉莉酸对根生长的抑制。已有研究表明 ERF 蛋白可以特异性结合到靶基因启动子序列中的 GCC-box 序列。TaSRL1 属于 ERF 家族。在生长素转运基因 TaPIN2 的启动子序列中含有一个 GCC-box 序列。酵母单杂交实验显示,TaSRL1 可以直接与 TaPIN2 启动子结合并***其表达(图 A),但该***作用会被TaSRL1的互作蛋白TaTIFY9 所抑制(图 B和C)。天津建库酵母文库做什么

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